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小麥D基因組完整圖譜首繪成功

11选5前三组选20注2017-11-22 來源:科技日報

11选5前三组选20注 www.sqfwb.com   據中國農科院最新消息,該院作物科學研究所研究員賈繼增領銜的研究團隊,在11选5前三组选20注D基因組測序研究中,揭示了轉座子(TE)在小麥基因組中的重要功能,完成了染色體級別的D基因組精細圖譜的繪制,并首次獲得一個完整的整合圖譜。相關研究論文20日在線發表于《自然·植物》期刊上。

  賈繼增介紹,小麥是世界最重要農作物之一,基因組巨大而且復雜,和其他作物相比轉座子含量特別高。這使得小麥基因組測序組裝異常困難。粗山羊草是小麥D基因組供體種,對小麥品種改良非常重要。該研究團隊在2013年完成了粗山羊草基因組草圖的繪制,研究成果在《自然》上發表,4年多來已被引用412次,成為小麥研究領域高被引論文之一。然而受當時技術條件所限,研究的深入與基因組信息的利用不足。

  近年來,該團隊利用二代、三代等測序技術與最新的組裝技術,對D基因組重新測序和組裝,將組裝質量提高210倍,完成了染色體級別的D基因組精細圖譜的繪制。利用高質量的組裝結果,準確地進行了基因注釋,構建了基因分布圖、基因表達圖、假基因分布圖、重復序列分布圖、甲基化分布圖、重組率分布圖和smallRNA分布圖。研究發現,粗山羊草基因組中有一批基因在近期發生了復制。

  研究還重點分析了TE對基因組結構、基因復制、假基因形成與基因表達的影響,發現有近1/2的基因中攜帶有TE,是已測序基因組中攜帶TE基因最多的物種,也是迄今為止報道的假基因數量最多的物種。TE通?;掛種蘋虻謀澩?。

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